Родился 21 ноября 1942 года в городе Гурьев.
Отец – Баекенов Абдрахман (1906–1985), работал начальником Пахтааральского, Сузакского районных отделов НКВД, Талды-Курганского городского отдела, заместителем начальника УНКВД Джамбулской, Южно-Казахстанской, Гурьевской, Западно-Казахстанской областей, майор. Мать – Баекенова (Арсланова) Фатима Газизовна (1912–1977), была домохозяйкой.
Окончил Уральский техникум механизации сельского хозяйства (1960); Карагандинский государственный университет (1972), учитель истории и обществоведения; Высшую школу КГБ СССР им. Ф.Э. Дзержинского (1975), офицер с высшим специальным образованием.
Профессор КазГЮУ (2001), почетный профессор КазГЮУ (2003).
С 1960 года – начальник автомотоклуба ДОСААФ, автомеханик Саранского автотреста, служба в рядах Советской Армии, заведующий внешкольными учебно- производственными мастерскими горОНО. С 1966 года – заведующий отделом; второй, первый секретарь Саранского горкома ЛКСМ Казахстана. С 1971 года – заведующий отделом Саранского горкома партии; второй секретарь Карагандинского обкома ЛКСМ Казахстана. С 1973 года – слушатель Высшей школы КГБ СССР им. Ф.Э. Дзержинского. С 1975 года – заместитель начальника отдела УКГБ по Карагандинской области. С 1977 года – заведующий отделом административных органов Карагандинского обкома партии. С 1980 года – заместитель начальника УКГБ по Алма-Атинской области. С 1982 года – старший инспектор Инспекторского управления КГБ СССР. С 1985 года – начальник УКГБ по Кокчетавской области. С 1986 года – заместитель председателя КГБ КазССР. С 1990 года – начальник УКГБ по Алма-Атинской области. С 1991 года – председатель КГБ – КНБ РК. С декабря 1993 года – секретарь Совета безопасности РК. С октября 1994 года – министр внутренних дел РК. С декабря 1995 года – президент ТОО «Сауран». С декабря 1996 года – заместитель генерального директора ЗАО «Group 4 Securitas Kazakhstan». С 1997 года – начальник Службы охраны Президента РК. С 2001 года – первый проректор Казахской государственной юридической академии, первый вице-президент Казахского гуманитарно-юридического университета, ректор Алматинской юридической академии КазГЮУ.
С августа 2003 года по настоящее время – генеральный директор ТОО «Специальная военизированная охрана «Глобус».
Президент Ассоциации охранных организаций Казахстана (с 2002 года по настоящее время).
Член Совета безопасности РК (1992–1995, 1997–2000). Член Правительства РК (1991–1992, 1994–1995).
Награжден орденами «Құрмет» (2001), «Звезда содружества»; 21 медалью. Почетный гражданин г. Сарань.
Почетный сотрудник КНБ, СОП РК.
Генерал-лейтенант.
Женат. Супруга – Баекенова Тамара Васильевна. Дочери – Индира (1964 г. р.), Илона, (1967 г. р.), Асель (1985 г. р.). Имеет 2 внучки.