Родился 9 февраля 1953 года в селе Бес Арык Яныкурганского района Кзыл-Ординской области. Казах.
Отец – Налибаев Машбек Сапарбайулы, бригадир. Мать – Налибаева Бибиш.
Окончил планово-экономический факультет Алма-Атинского института народного хозяйства (1977), экономист.
Доктор экономических наук (1999). Тема докторской диссертации: «Управление инвестиционными процессами в производственно-хозяйственной системе». Почетный член Академии социальных наук РК (1996).
Автор книг «Экономика региона в переходный период» (1995), «Специальные экономические зоны. Опыт создания» (1996), «Таможенный кодекс Республики Казахстан» (2003), комментарий к Таможенному кодексу Республики Казахстан (2005).
Владеет казахским, русским, турецким и английским (со словарем) языками.
С августа 1969 года – рабочий, разнорабочий отделения №3 совхоза «Задаринский» Яныкурганского района Кзыл-Ординской области. С мая 1971 года – служба в рядах Советской Армии. С августа по сентябрь 1977 года – ревизор Казахского республиканского управления гострудсберкасс. С октября 1977 года – экономист, с октября 1978 года – старший экономист, с мая 1983 года – ведущий экономист, с июля 1985 года – главный экономист, с марта 1986 года – заместитель начальника отдела Управления финансирования культуры и здравоохранения Министерства финансов КазССР. С 1988 года – начальник планово-финансового управления Министерства народного образования КазССР. С 1990 года – заместитель министра образования РК. С 1994 года – заместитель заведующего отделом финансов, труда и социальной защиты населения Аппарата Президента РК и Кабинета министров РК, заместитель заведующего, заведующий отделом финансов, труда и социальной защиты населения Управления делами Кабинета министров РК. С марта 1995 года – руководитель Аппарата Кабинета министров РК. С сентября 1995 года – аким Кызылординской области. С 1999 года – аким Южно-Казахстанской области. С 2002 года – председатель Агентства таможенного контроля РК. С 2004 года – вице-министр финансов – председатель Комитета таможенного контроля Министерства финансов РК. С 2006 года – заместитель руководителя Канцелярии Премьер-министра РК – представитель Правительства в Мажилисе Парламента РК. С 2007 года – вице-министр экономики и бюджетного планирования РК, министр труда и социальной защиты населения РК.
С 2009 года по настоящее время – аким Восточно-Казахстанской области.
Награжден орденами «Құрмет» (1999), «Парасат» (2007); медалями «Астана» (1998), «Қазақстан Республикасының тәуелсіздігіне 10 жыл» (2001), «Қазақстан Конституциясына 10 жыл» (2005).
Воинское звание – полковник в запасе.
Религиозные взгляды – ислам.
Идеал политического деятеля – Н.А. Назарбаев, Б. Клинтон.
Прогноз будущего Казахстана – «Стабильность и процветание Казахстана».
Хобби – большой теннис, футбол.
Литературные пристрастия – исторический жанр, приключения, детективы.
Женат. Супруга – Сапарбаева Калдыгайша Зейнулловна (1955 г. р.). Дочь – Сапарбаева Акбота Бердыбековна (1978 г. р.); сыновья – Сапарбаев Бауыржан Бердыбекович (1983–2002), Сапарбаев Жансултан Бердыбекович (1991 г. р.).